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大学历任校长
孙家鼐 (1898. 7 ----- 1900. 春) 安徽寿州（今寿县）人
许景澄 (1900. 春 ----- 1900. 8) 浙江嘉兴人
张百熙 (1902. 1 ----- 1904. 1) 湖南长沙人
张亨嘉 (1904. 1 ----- 1906. 2) 今福州市人
李家驹 (1906. 3 ----- 1907. 8) 汉军正黄旗人
朱益藩 (1907. 8 ----- 1908. 1) 江西莲花人
刘廷琛 (1908. 1 ----- 1911. 12) 江西九江人
柯劭愍 (1910. 12 ----- 1911. 12) 山东胶县人
劳乃宣 (1911. 12 ----- 1912. 2) 河北省广平府（今河北省永年县广府镇）
严复 (1912. 2 ----- 1912. 10) 福建侯官人
章士钊 (1912. 10 ----- 1912. 12) 湖南长沙人
何燮侯 (1912. 12 ----- 1913. 11) 浙江诸暨枫桥人
胡仁源 (1913. 11 ----- 1916. 12) 浙江吴兴人
蔡元培 (1916. 12 ----- 1927. 7) 浙江绍兴山阴人
刘哲 (1927. 8 ----- 1928. 6) 吉林永吉（今吉林省九台）人
李煜嬴 (1928. 6 ----- 1929. 1) 河北高阳人
陈大齐 (1929. 1 ----- 1929. 8) 浙江海盐人
蔡元培 (1929. 9 ----- 1930. 12) 浙江绍兴山阴人
蒋梦麟 (1930. 12 ----- 1945. 10) 浙江余姚人（12岁开始读书在绍兴中西学堂）
胡适 (1945. 10 ----- 1948. 12) 安徽绩溪人
汤用彤 (1949. 5 ----- 1951. 9) 祖籍湖北省黄梅县，生于甘肃省渭源县
马寅初 (1951. 9 ----- 1960. 3) 浙江嵊县（今嵊州市）人
陆平 (1957. 10 ----- 1966. 5) 吉林长春人
周培源 (1978. 7 ----- 1981. 3) 江苏省宜兴县
张龙翔 (1981. 6 ----- 1984. 3) 浙江吴兴（今湖州）人
丁石孙 (1984. 3 ----- 1989. 8) 江苏镇江人
吴树青 (1989. 8 ----- 1996. 8) 江苏江阴人
陈佳洱 (1996. 7 ----- 1999. 12) 上海人
许智宏 （2000.1-----2008.11 ） 江苏无锡人
周其凤（2008.12------） 湖南浏阳龙伏镇尚埠村人